MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011989	CGC	2	6	348383	348388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147328
6002	NC_011989	GCC	2	6	348406	348411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147328
6003	NC_011989	GTTC	2	8	348446	348453	0 %	50 %	25 %	25 %	222147328
6004	NC_011989	CGAC	2	8	348518	348525	25 %	0 %	25 %	50 %	222147328
6005	NC_011989	GCG	2	6	348579	348584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147328
6006	NC_011989	GGT	2	6	348672	348677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147328
6007	NC_011989	ACG	2	6	348727	348732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147328
6008	NC_011989	CGG	2	6	348754	348759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147328
6009	NC_011989	TAT	2	6	348761	348766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147328
6010	NC_011989	TTC	2	6	348811	348816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147328
6011	NC_011989	TGC	2	6	348822	348827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147328
6012	NC_011989	GCG	2	6	348838	348843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147328
6013	NC_011989	CGT	2	6	348977	348982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147329
6014	NC_011989	CGA	2	6	349006	349011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147329
6015	NC_011989	GCC	2	6	349019	349024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147329
6016	NC_011989	CTG	2	6	349103	349108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147329
6017	NC_011989	ATCG	2	8	349142	349149	25 %	25 %	25 %	25 %	222147329
6018	NC_011989	CGC	2	6	349165	349170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147329
6019	NC_011989	CAC	2	6	349202	349207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147329
6020	NC_011989	GTG	3	9	349227	349235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147329
6021	NC_011989	ACC	2	6	349242	349247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147329
6022	NC_011989	TGG	2	6	349357	349362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147329
6023	NC_011989	GCAA	2	8	349424	349431	50 %	0 %	25 %	25 %	222147329
6024	NC_011989	GGAA	2	8	349435	349442	50 %	0 %	50 %	0 %	222147329
6025	NC_011989	CGGT	2	8	349498	349505	0 %	25 %	50 %	25 %	222147330
6026	NC_011989	TGTC	2	8	349541	349548	0 %	50 %	25 %	25 %	222147330
6027	NC_011989	TGA	2	6	349583	349588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147330
6028	NC_011989	CGG	2	6	349651	349656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147330
6029	NC_011989	GA	3	6	349683	349688	50 %	0 %	50 %	0 %	222147330
6030	NC_011989	CGG	2	6	349762	349767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147330
6031	NC_011989	TCA	2	6	349773	349778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147330
6032	NC_011989	TGA	2	6	349813	349818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147330
6033	NC_011989	GC	3	6	349870	349875	0 %	0 %	50 %	50 %	222147330
6034	NC_011989	TGGC	2	8	349897	349904	0 %	25 %	50 %	25 %	222147330
6035	NC_011989	GAC	2	6	349913	349918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147330
6036	NC_011989	TGT	2	6	349954	349959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147330
6037	NC_011989	GAC	2	6	349976	349981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147330
6038	NC_011989	CAA	2	6	349990	349995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147330
6039	NC_011989	ACG	2	6	350010	350015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147330
6040	NC_011989	GGCAA	2	10	350025	350034	40 %	0 %	40 %	20 %	222147330
6041	NC_011989	GCC	2	6	350041	350046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147330
6042	NC_011989	GACC	2	8	350062	350069	25 %	0 %	25 %	50 %	222147330
6043	NC_011989	AGG	2	6	350080	350085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147330
6044	NC_011989	TCG	2	6	350820	350825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147331
6045	NC_011989	TGG	2	6	351155	351160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147332
6046	NC_011989	GTG	2	6	351202	351207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147332
6047	NC_011989	TG	3	6	351218	351223	0 %	50 %	50 %	0 %	222147332
6048	NC_011989	TGA	2	6	351270	351275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147332
6049	NC_011989	GC	3	6	351293	351298	0 %	0 %	50 %	50 %	222147332
6050	NC_011989	CTT	2	6	351300	351305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147332
6051	NC_011989	CTG	2	6	351313	351318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147332
6052	NC_011989	T	6	6	351324	351329	0 %	100 %	0 %	0 %	222147332
6053	NC_011989	GGCA	2	8	351342	351349	25 %	0 %	50 %	25 %	222147332
6054	NC_011989	GC	3	6	351387	351392	0 %	0 %	50 %	50 %	222147332
6055	NC_011989	TGC	2	6	351408	351413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147332
6056	NC_011989	TGGCG	2	10	351421	351430	0 %	20 %	60 %	20 %	222147332
6057	NC_011989	CAG	2	6	351439	351444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147332
6058	NC_011989	AAG	2	6	351445	351450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147332
6059	NC_011989	CGAGC	2	10	351451	351460	20 %	0 %	40 %	40 %	222147332
6060	NC_011989	ACC	2	6	351828	351833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147333
6061	NC_011989	CCG	2	6	351860	351865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147333
6062	NC_011989	TCC	2	6	351877	351882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147333
6063	NC_011989	CT	3	6	352229	352234	0 %	50 %	0 %	50 %	222147333
6064	NC_011989	GCC	2	6	352236	352241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147333
6065	NC_011989	CGATG	2	10	352272	352281	20 %	20 %	40 %	20 %	222147333
6066	NC_011989	CGA	2	6	352296	352301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147333
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6070	NC_011989	GCC	2	6	352625	352630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147333
6071	NC_011989	CGA	2	6	352659	352664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147333
6072	NC_011989	GCG	2	6	352692	352697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147333
6073	NC_011989	CAT	2	6	352713	352718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147333
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6075	NC_011989	CAG	2	6	353004	353009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147333
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6078	NC_011989	GGC	2	6	353310	353315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147334
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6081	NC_011989	GTGC	2	8	353571	353578	0 %	25 %	50 %	25 %	222147334
6082	NC_011989	ACC	2	6	353616	353621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147334
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6085	NC_011989	TACCG	2	10	353697	353706	20 %	20 %	20 %	40 %	222147334
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6089	NC_011989	GC	3	6	353796	353801	0 %	0 %	50 %	50 %	222147334
6090	NC_011989	TCT	2	6	353879	353884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147334
6091	NC_011989	CGA	2	6	353891	353896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147334
6092	NC_011989	GCT	2	6	353962	353967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147335
6093	NC_011989	CATG	2	8	354013	354020	25 %	25 %	25 %	25 %	222147335
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6095	NC_011989	TCG	2	6	354114	354119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147335
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6100	NC_011989	CTG	2	6	354353	354358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147335
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6102	NC_011989	CTG	2	6	354365	354370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147335
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6104	NC_011989	CATC	2	8	354855	354862	25 %	25 %	0 %	50 %	222147336
6105	NC_011989	GTCA	2	8	354902	354909	25 %	25 %	25 %	25 %	222147336
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6109	NC_011989	ATTG	2	8	355033	355040	25 %	50 %	25 %	0 %	222147336
6110	NC_011989	CTT	2	6	355046	355051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147336
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6113	NC_011989	TGT	2	6	355137	355142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147336
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6120	NC_011989	AGA	2	6	355360	355365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147336
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6122	NC_011989	GTG	2	6	355422	355427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147336
6123	NC_011989	TGA	2	6	355461	355466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147336
6124	NC_011989	GGT	2	6	355475	355480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147336
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6127	NC_011989	GCT	2	6	355585	355590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147336
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6133	NC_011989	TCCG	2	8	355899	355906	0 %	25 %	25 %	50 %	222147336
6134	NC_011989	TGC	2	6	355932	355937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147336
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6230	NC_011989	GCCA	2	8	361538	361545	25 %	0 %	25 %	50 %	222147340
6231	NC_011989	TTGA	2	8	361547	361554	25 %	50 %	25 %	0 %	222147340
6232	NC_011989	GTCA	2	8	361574	361581	25 %	25 %	25 %	25 %	222147340
6233	NC_011989	CGG	2	6	361620	361625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147340
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6235	NC_011989	TGC	2	6	361965	361970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147341
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6238	NC_011989	A	6	6	362018	362023	100 %	0 %	0 %	0 %	222147341
6239	NC_011989	GGC	2	6	362044	362049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147341
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6241	NC_011989	GAT	2	6	362095	362100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147341
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6474	NC_011989	CTGG	2	8	374402	374409	0 %	25 %	50 %	25 %	222147352
6475	NC_011989	TGT	2	6	374449	374454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147352
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6482	NC_011989	TC	3	6	374742	374747	0 %	50 %	0 %	50 %	222147353
6483	NC_011989	GGACA	2	10	374798	374807	40 %	0 %	40 %	20 %	222147353
6484	NC_011989	CCAA	2	8	374810	374817	50 %	0 %	0 %	50 %	222147353
6485	NC_011989	TGTCC	2	10	374818	374827	0 %	40 %	20 %	40 %	222147353
6486	NC_011989	GCG	2	6	374915	374920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147353
6487	NC_011989	TCC	2	6	374973	374978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147353
6488	NC_011989	GGA	2	6	375016	375021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147353
6489	NC_011989	CTC	3	9	375163	375171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147354
6490	NC_011989	ATC	2	6	375220	375225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147354
6491	NC_011989	GCC	2	6	375239	375244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147354
6492	NC_011989	CGG	2	6	375262	375267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147354
6493	NC_011989	GAG	2	6	375317	375322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147354
6494	NC_011989	CCG	2	6	375330	375335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147354
6495	NC_011989	TGTCGA	2	12	375421	375432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222147354
6496	NC_011989	TGA	2	6	375450	375455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147354
6497	NC_011989	GAT	2	6	375509	375514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147354
6498	NC_011989	TCT	2	6	375541	375546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147354
6499	NC_011989	AACGGC	2	12	375572	375583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147354
6500	NC_011989	GGA	2	6	375619	375624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147354

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